代谢组学技术在中药研究中的应用主要体现在以下几个方面：
1. 中药成分分析与质量控制
组成签别：分泌率组学枝术才能对中西药才中的电学式组成通过全面、明确浅析，签别出药草中的电学活化组成。列举，利用率体系结构质谱（MS）的分泌率组学枝术，可能签别出西洋参中的西洋参皂苷等电学活化组成。这款枝术还可能区别入药和非入药要素的电学式标上物，为中西药才的产品品质操纵保证理论依据。
线产品的质量管控：凭借消化吸收组学水平，就能够对中要材的线产品的质量来评价和管控。比如说，巧用沉水草本植物消化吸收组学深入分析，就能够发展重视类类风湿性关节软骨炎的中要材组分的线产品的质量标记符号的生物制品发光法具体方法。不仅，消化吸收组学还就能够判断中要材中的致癌性组分和其致癌性缘由，如凭借UPLC-Q-TOF-MS调查，界定各不相同乌头沉水草本植物的生物制品组分，并判断有着镇痛药生物制品和发生急性致癌性的生物制品碱。
2. 中药药效机制研究
用靶点判别：消化吸收组学高技术是可以有所帮助判别药材可溶性有效成分的分子式靶点。列举，分析发掘雷公藤红素可能够 调低Treg/TH1和Treg/Th17不平衡量、阻绝NF-κB信号通路等管理机制挥发抗感染用。
目的策略化加以讲解：产生组学系统可能探求中要疗法疫情的目的策略化。列如 ，讲解察觉到青蒿素耐药性与疟原虫的线粒体产生影响关与，非靶向疗法产生组学探求了与该环节有关系的产生物改变。不仅而且，产生组学还能够顺利通过讲解产生物的改变，讲解中要复方的目的策略化。
3. 中药安全性评价
渗透性系统设计：新陈分解组学技巧能够 用在设计中西药的渗透性系统。诸如，采用新陈分解组学和16S rDNA测序的合并剖析，蕴含了清益汤对危重症急慢性膀胱胰腺炎想关急慢性膀胱肺影响的保护英文系统，并制定了铁处变不惊、文化差异新陈分解物和微生物培养基体菌群之中的的联系。
可靠性监测：新陈代谢组学技术性还不错用作草药的可靠性监测，判断隐藏的致毒成份和致毒靶点，故而为草药的可靠施用具备科学实验标准。
4. 中医证候研究
证候关联排泄物浅析：排泄组学技巧可用在表现与中国传统医学证候关联的内源性排泄物改变，助手中国传统医学证候的确诊和矫治。随后，能够 排泄组学设计，已在冠心脏病患病者中鉴定会出与痰瘀证和和气气阴两虚证关联的海洋生物标签物。
证候行为矫正的研究探讨：基础代谢转化组学能力还够 采用的研究探讨药材对中医理论证候的行为矫正特效。比如，顺利通过基础代谢转化组学能力及聚类了解了解法，得知“黄芪-茯苓-泽泻”等绑定药配置适采用肾病宗合征的新组方药，够对三种肾病宗合征各种相关的动物标签物会产生应响。
5. 多组学技术整合应用
多个学资源资源优化配置：细胞代谢组学与的组学方法（如基因遗传组学、转录组学、淀粉酶质组学等）的资源资源优化配置广泛软件，为药材探索出示打了个个多纬度的研究整体布局完成后。这类资源资源优化配置广泛软件一方面增强了我对药材部分在原子要素上对人体组织内分泌系统和方面的问题阶段的不良影响，还为阐释药材的的功效新机制和药物产品基础知识出示了强坚实的道具。
重大消化道疾病诊疗体系：几组学技术工艺可中用探析中药方诊疗重大消化道疾病的原子核体系。比如说，利用淀粉酶质组学和基础代谢率组学的联合技术app，蕴含了与中医学进行分类的膝膝盖骨骨性膝盖骨炎频繁有关的的相互影响传达淀粉酶和基础代谢率通道。
排泄组学方法在成药才钻研中的适用，为成药才的近代化和精准扶贫医治展示了很重要的有效适配，能有效的深入推进成药才的要求化和展览化發展。